本试剂盒由上海语燕生物出品,采用可以特异性结合 DNA 的离心吸附柱和缓冲液系统,提取细菌基因组 DNA。离心吸附柱中采用的硅基质材料为上海语燕生物新型材料,能够高效专一吸附 DNA,可最大限度去除杂质蛋白及细胞中其他有机化合物。提取的基因组 DNA 片段大,纯度高,质量稳定可靠。使用本试剂盒提取的基因组 DNA 可用于各种常规操作,包括酶切、PCR、文库构建、Southern 杂交等实验。
使用前请先在漂洗液中加入无水乙醇,加入体积请参照瓶体上的标签。所有离心步骤均为使用台式离心机在室温下离心。本试剂盒仅适用于革兰氏阴性菌基因组提取,若用于革兰氏阳性菌基因组提取,需自备部分试剂或者选购 “R32717 革兰氏阳性菌基因组 DNA 提取试剂盒"。
收集菌体:取细菌培养液 1 - 5mL,12000 rpm 离心 1 min.,尽量吸除上清。
菌体悬浮与 RNA 去除(革兰氏阴性菌):向菌体中加入 250 μL 溶液 A,振荡或用移液器吹打使菌体充分悬浮,向悬浮液中加入 40 μL 的 RNase A (10 mg/mL),振荡 15sec,室温放置 5 min。
菌体悬浮与破壁(革兰氏阳性菌,额外步骤):如果是革兰氏阳性菌,可在第 2 步操作前加入溶菌酶溶液进行破壁处理,溶菌酶及溶菌酶缓冲液需自备。具体方法为:向菌体加入 500uL 70% 乙醇,冰浴 20min,12000rpm 离心 1min,弃上清,菌体沉淀加入 110μL 溶菌酶的缓冲液(20mM Tris, pH8.0;2mM Na2 - EDTA;1.2% Triton X - 100)和 70μL 溶菌酶溶液(50 - 100mg/mL),37℃处理 30 - 60min。之后再进行后续步骤。
蛋白酶 K 处理:向管中加入 20μL 的蛋白酶 K (10mg/mL),充分混匀,70℃放置 10 min,此时可见菌液呈清亮粘稠状。
溶液 B 处理:向管中加入 220 μL 溶液 B,振荡 15sec,70℃放置 10 min,瞬时离心以去除管盖内壁的水珠。
乙醇添加与混合:向管中加入 220 μL 无水乙醇,充分混匀,振荡 15sec,溶液变清亮,此时还可能会出现絮状沉淀,不影响 DNA 的提取,可将溶液和絮状沉淀都加入到吸附柱中,静置 2 min。
离心与弃废液:12000 rpm 离心 2 min. 弃废液,将吸附柱放入收集管中。
第一次漂洗:向吸附柱中加入 600μL 漂洗液 (使用前请先检查是否己加入无水乙醇)。12000 rpm 离心 1 min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
第二次漂洗:向吸附柱中加入 600μL 漂洗液。12000 rpm 离心 1 min,弃废液,将吸附柱放入收集管中。
第三次漂洗:重复操作步骤 8。
去除残余漂洗液:12000 rpm 离心 2 min,将吸附柱敞口置于室温或 50℃温箱放置数分钟,目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,否则漂洗液中的乙醇会影响后续实验,如酶切、PCR 等。
洗脱液添加与室温放置:将吸附柱放入一个干净的离心管中,向吸附膜中央悬空滴加 50 - 200 μL 经 65℃水浴预热的洗脱液,室温放置 5 min,12000 rpm 离心 1 min。
再次洗脱:离心所得洗脱液再加入吸附柱中,室温放置 2 min ,12000 rpm 离心 2 min,即可得到高质量的细菌基因组 DNA。